MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 1

Total Repeats: 74602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009049	GCC	2	6	88	93	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460779
2	NC_009049	GCG	2	6	184	189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
3	NC_009049	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
4	NC_009049	CGG	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
5	NC_009049	TCG	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
6	NC_009049	GAC	2	6	321	326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460779
7	NC_009049	TCG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
8	NC_009049	GCC	2	6	358	363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460779
9	NC_009049	GC	3	6	410	415	0 %	0 %	50 %	50 %	126460779
10	NC_009049	CGG	4	12	424	435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
11	NC_009049	CGC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460779
12	NC_009049	GCT	2	6	488	493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
13	NC_009049	CG	3	6	569	574	0 %	0 %	50 %	50 %	126460779
14	NC_009049	CGT	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
15	NC_009049	GTG	3	9	591	599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126460779
16	NC_009049	GGT	3	9	680	688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126460779
17	NC_009049	CGC	2	6	709	714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460779
18	NC_009049	GGC	2	6	737	742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
19	NC_009049	TGC	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
20	NC_009049	TCG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
21	NC_009049	GCG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
22	NC_009049	GGC	2	6	854	859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
23	NC_009049	CG	3	6	915	920	0 %	0 %	50 %	50 %	126460779
24	NC_009049	TCT	2	6	958	963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126460779
25	NC_009049	GGA	2	6	989	994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460779
26	NC_009049	CTG	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
27	NC_009049	CCTG	2	8	1109	1116	0 %	25 %	25 %	50 %	126460779
28	NC_009049	GCT	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460779
29	NC_009049	GAT	3	9	1190	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460779
30	NC_009049	GATCC	2	10	1222	1231	20 %	20 %	20 %	40 %	126460779
31	NC_009049	GCG	2	6	1242	1247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460779
32	NC_009049	CCGG	2	8	1376	1383	0 %	0 %	50 %	50 %	126460780
33	NC_009049	CGT	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460780
34	NC_009049	GAC	3	9	1413	1421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460780
35	NC_009049	GCC	2	6	1454	1459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460780
36	NC_009049	GC	3	6	1461	1466	0 %	0 %	50 %	50 %	126460780
37	NC_009049	CG	3	6	1467	1472	0 %	0 %	50 %	50 %	126460780
38	NC_009049	G	6	6	1551	1556	0 %	0 %	100 %	0 %	126460780
39	NC_009049	GGC	2	6	1602	1607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460780
40	NC_009049	TCG	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460780
41	NC_009049	AGC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460780
42	NC_009049	GCC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460781
43	NC_009049	GCC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460781
44	NC_009049	CTG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460781
45	NC_009049	GCC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460781
46	NC_009049	GGC	2	6	1855	1860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460781
47	NC_009049	GCC	3	9	2164	2172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
48	NC_009049	CGGA	2	8	2232	2239	25 %	0 %	50 %	25 %	126460782
49	NC_009049	CGAA	2	8	2250	2257	50 %	0 %	25 %	25 %	126460782
50	NC_009049	CCG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
51	NC_009049	CGA	3	9	2352	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460782
52	NC_009049	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
53	NC_009049	G	7	7	2591	2597	0 %	0 %	100 %	0 %	126460782
54	NC_009049	GCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
55	NC_009049	GTC	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
56	NC_009049	CCG	2	6	2730	2735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
57	NC_009049	GCA	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460782
58	NC_009049	GGA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460782
59	NC_009049	CAG	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460782
60	NC_009049	TGC	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
61	NC_009049	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
62	NC_009049	TCT	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126460782
63	NC_009049	CGG	3	9	3090	3098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
64	NC_009049	CCG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
65	NC_009049	GAC	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460782
66	NC_009049	CTG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
67	NC_009049	CTG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
68	NC_009049	AAG	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126460782
69	NC_009049	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460782
70	NC_009049	GGA	2	6	3632	3637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460782
71	NC_009049	GGA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460782
72	NC_009049	TCG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
73	NC_009049	GGC	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
74	NC_009049	CCTG	2	8	3808	3815	0 %	25 %	25 %	50 %	126460782
75	NC_009049	TCC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126460782
76	NC_009049	GC	3	6	3878	3883	0 %	0 %	50 %	50 %	126460782
77	NC_009049	GCG	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
78	NC_009049	GCG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
79	NC_009049	AGG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460782
80	NC_009049	GTC	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460782
81	NC_009049	GGT	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126460782
82	NC_009049	CGGAC	2	10	4044	4053	20 %	0 %	40 %	40 %	126460782
83	NC_009049	ATG	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460782
84	NC_009049	CGG	2	6	4141	4146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460782
85	NC_009049	GCC	3	9	4159	4167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460782
86	NC_009049	TCA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126460783
87	NC_009049	TCC	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126460783
88	NC_009049	AGC	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460783
89	NC_009049	GC	3	6	4599	4604	0 %	0 %	50 %	50 %	126460783
90	NC_009049	CGC	2	6	4666	4671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460783
91	NC_009049	AGG	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460783
92	NC_009049	CGG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460783
93	NC_009049	GGGC	2	8	4725	4732	0 %	0 %	75 %	25 %	126460783
94	NC_009049	ATC	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126460783
95	NC_009049	GC	3	6	4850	4855	0 %	0 %	50 %	50 %	126460783
96	NC_009049	GGC	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460783
97	NC_009049	AGC	2	6	4862	4867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460783
98	NC_009049	CTC	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126460783
99	NC_009049	TGA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460783
100	NC_009049	G	6	6	4888	4893	0 %	0 %	100 %	0 %	126460783
101	NC_009049	CTGCG	2	10	4920	4929	0 %	20 %	40 %	40 %	126460783
102	NC_009049	AGCCC	2	10	4974	4983	20 %	0 %	20 %	60 %	126460784
103	NC_009049	CGC	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460784
104	NC_009049	CGA	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460784
105	NC_009049	CGA	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460784
106	NC_009049	CGGG	2	8	5180	5187	0 %	0 %	75 %	25 %	126460784
107	NC_009049	CGAG	2	8	5215	5222	25 %	0 %	50 %	25 %	126460784
108	NC_009049	CG	3	6	5223	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
109	NC_009049	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460784
110	NC_009049	AGG	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460784
111	NC_009049	CG	3	6	5378	5383	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
112	NC_009049	TCG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460784
113	NC_009049	GAT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460784
114	NC_009049	CGG	2	6	5505	5510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460784
115	NC_009049	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460784
116	NC_009049	GCC	2	6	5524	5529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460784
117	NC_009049	ATG	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460784
118	NC_009049	ATA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126460784
119	NC_009049	AAG	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126460784
120	NC_009049	CG	3	6	5650	5655	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
121	NC_009049	GGCC	2	8	5677	5684	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
122	NC_009049	GCCG	2	8	5819	5826	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
123	NC_009049	CAC	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126460784
124	NC_009049	TCGG	2	8	5889	5896	0 %	25 %	50 %	25 %	126460784
125	NC_009049	GGC	2	6	5902	5907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460784
126	NC_009049	GAG	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460784
127	NC_009049	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126460784
128	NC_009049	GCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460784
129	NC_009049	GC	3	6	5976	5981	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
130	NC_009049	CG	4	8	6036	6043	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
131	NC_009049	GCC	2	6	6063	6068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460784
132	NC_009049	TTC	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126460784
133	NC_009049	GGC	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460784
134	NC_009049	CAC	2	6	6209	6214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126460784
135	NC_009049	GGCC	2	8	6254	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	126460784
136	NC_009049	CGG	2	6	6287	6292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460784
137	NC_009049	CCA	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126460784
138	NC_009049	GGCG	2	8	6365	6372	0 %	0 %	75 %	25 %	126460784
139	NC_009049	CATC	2	8	6373	6380	25 %	25 %	0 %	50 %	126460784
140	NC_009049	TGG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126460784
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144	NC_009049	CAT	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126460785
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157	NC_009049	CG	3	6	7401	7406	0 %	0 %	50 %	50 %	126460786
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165	NC_009049	GC	4	8	7642	7649	0 %	0 %	50 %	50 %	126460786
166	NC_009049	GC	3	6	7665	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	126460786
167	NC_009049	TGG	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126460786
168	NC_009049	GGC	2	6	7703	7708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126460786
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250	NC_009049	CGGT	2	8	11724	11731	0 %	25 %	50 %	25 %	126460790
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255	NC_009049	GAG	2	6	11913	11918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126460790
256	NC_009049	TGC	2	6	11926	11931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460790
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262	NC_009049	TCG	2	6	12252	12257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126460790
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264	NC_009049	CGA	2	6	12365	12370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460790
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389	NC_009049	CAG	2	6	17141	17146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460794
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392	NC_009049	GGCG	2	8	17221	17228	0 %	0 %	75 %	25 %	126460794
393	NC_009049	GCA	2	6	17272	17277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126460794
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395	NC_009049	CGC	2	6	17314	17319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126460794
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498	NC_009049	CAAGGA	2	12	21605	21616	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126460798
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